数字化发展新理念下生物医药科学数据共享平台的构建原则及措施

杨 燕，严靖婷，王光宇，丁 剑

(1.云南省科学技术院，昆明 650051；

2.云南蓝典科技股份有限公司，昆明 650031)

以数字化发展新理念为引领，构建生物医药科学数据共享平台，提升数据信息管理效果及共享水平，满足生物医药科学数据全面处理和共享的需求，推动相关科学数据的开发利用。在数字化发展新理念下，生物医药产业应重视科学数据共享平台的构建与开发，以达到预期的平台发展目标。

1.1 构建原则

在数字化发展新理念下，构建相关的数据共享平台，需要遵循各类基本原则，如图1所示。

图1 平台构建原则Fig.1 Principle of platform construction

1.1.1 遵循医药科技产业的数据信息共享原则

在构建数据共享平台过程中，要合理开发内部和外部信息门户网站，设置标准化的网络安全认证机制和协议，为不同的服务对象开放有关的数据信息共享平台系统，确保每套数据能供很多平台共享和使用。平台能根据服务对象共享情况选择合适的信息内容，确保可以进行信息资源的全面高效化利用、增值开发利用，拓宽数据信息的采集渠道。要遵循数据信息清洗算法、自然语言理解算法，推出数据信息交叉验证服务和高质量的数据共享服务，避免不同机构和单位进行相同数据的反复采集。

1.1.2 遵循数据信息集中化存储和管理原则

建议在不同分布类型、异构类型、自治类型的数据源内进行数据信息的集成处理，开发数据仓库系统，对比数据差异性，确保相同数据信息在不同类型的系统中都能符合一致性和完整性要求。需要对不同应用平台所需要的核心数据信息字段进行筛选和抓取，为发现知识、制定完善的决策等提供共享数据信息，集中化进行各类数据信息的存储和管理，全面彰显数据共享平台的作用和价值。

1.1.3 遵循数据信息统计分析和决策支持原则

以不同的信息化平台为基础，对数据仓库内的多元化数据进行融合与提取，使用空间数据挖掘技术和分析技术，构建空间知识的发现算法和模型，全面进行生物医药产业各类科学数据信息的研究与分析，为科研机构、企业各部门制定决策方案提供准确依据。

1.2 明确平台建设要求

开发设计能够进行扩展的分布式体系架构，构建企业和相关机构无缝隙集成的异构平台和接口体系，打造企业信息申报与监管的智能化平台系统。以GIS技术为基础，构建生物医药企业知识发现系统和决策支持系统，支持数据信息的可视化分析。信息申报的模块主要设计在网络平台中，设置B/S架构，利用外网即可进行访问。在B/S系统方面设置java的架构形式时，桌面的应用系统需使用先进的visual studio技术，并利用SOA技术和WEB技术等集成不同技术的架构。数据通信部分主要设置XML的接口形式，利用全面性统一的接口协议解析模块和生成模块进行处理，强化共享数据信息的传输安全管理力度，通过远程技术在线进行系统参数管控，避免出现数据泄露、篡改、欺诈等现象。在中心平台和其他单位，可以使用现代化的跨平台数据整合技术对远程数据进行共享处理、集成处理、交互处理，同时通过SOA技术和WEB技术等对生物医药产业申报的数据信息进行双向集成。要合理设计现代化工作流引擎，进行审批流程监管，同时设计现代化报表引擎，为基础数据的分析和查询提供支持，并推出不同类型数据格式的报表导出功能。可利用现代化数据仓库技术和工具，构建生物医药产业领域的数据仓库系统，或采用现代化数据挖掘算法，为生物医药产业进行政策信息研究和数据分析提供支持，及时发现知识，进行数据信息的集聚处理与集成化处理。使用安全控制软件和CA技术能够有效维护数据共享平台的安全性，降低安全风险，确保数据共享平台的高效化、稳定性运行[1]。

2.1 完善平台架构

在生物医药科学数据共享平台的开发建设过程中，需完善平台中的功能模块，如文献库模块、知识库模块和数据集模块，通过各类模块向服务对象提供高质量的数据信息共享服务，充分发挥各类功能模块的价值，具体如图2所示。

图2 平台系统的功能模块Fig.2 Function module of platform system

2.1.1 知识库模块的设计

数据共享平台中知识库模块的设计主要是将各类生物医药图书按学科内容、专业知识等进行分类与整合，把疾病当做知识的核心部分，拓展药品方面、辅助检查方面、循证医学证据方面的知识，形成网络知识服务平台，将数字化过程与增值书刊等知识资本相结合，对书刊出版模式进行创新，让信息资源管理向着知识管理的方向发展，优化生物医药学知识获取途径，使学习变得更加便利。在设计生物医学知识库的过程中，主要涉及疾病类型、药品类型、手术学类型、辅助检查类型、循证医学证据类型、疾病研究进展类型、手术图谱类型的数据库系统，还包括医保药品类型的数据库系统、其他知识服务与产品的数据库系统等。可利用不同知识点间的内在联系，对各类数据库进行有机整合，强化不同数据库之间的知识链接处理力度，为生物医药学知识的共享提供保障。

2.1.2 文献库系统的开发构建

文献库的开发构建需要满足相关产业和企业对数据共享的需求。应以CMCC、CMAC、CMCI等为基础，全面整合、集成、收集相关文献数据，确保各类信息的良好应用。重点以CMCC为基础，合理开发相关文献库和数据库，用以检索上千种生物医学期刊、几百种生物医学核心期刊、上百万期刊文献，丰富数据共享平台中的各类文献和数据信息，提升文献库建设水平，充分发挥不同文献库的作用和价值。在开发相关文献库的过程中，需在文献库内部存储西方国家语言的文献内容及纸张类型书刊、免费类型期刊、电子期刊、核心期刊[2]等。

2.2 知识服务功能的设计

生物医药科学数据共享平台建设，应重点进行知识服务功能的设计和优化，确保平台系统能够有效完成各项知识服务任务，提升数据共享平台的应用价值和服务水平。

2.2.1 把知识元当做知识库构建的基本要素

从本质层面而言，知识由各个不同类型的知识单元组合而成。知识单元内涉及很多不同的片段知识，是由不同的知识元组合而成。每个独立性的知识元能够根据逻辑关系组合成知识单元。知识元相互之间有着一定的逻辑关系，被称作是知识元的链接，其中的某种知识体系就是由各类知识单元组合而成。不同知识单元是各类独立的知识元利用知识元的链接进行排列组合而成，各类知识相互间可以利用知识元的链接形成各种知识链，编织成整体的知识架构和知识网络。知识库就是利用知识元链接组合成的枢纽，在知识网络内能够存取任何知识元和单元[3]。

2.2.2 合理进行文献知识元的抽取处理

如果将不同的文献当做是知识结构中的知识单元，就会在知识结构之间形成个性知识和共识知识系统，其中的个性知识就是对知识进行创新，共识知识就是保证知识的完整度。在此过程中，知识结构可以利用公式进行表达：[知识单元1，知识单元2，……知识单元n]。知识单元也可以利用公式进行表达：[知识元1，知识元2，……知识元n]。各类知识元内容的对比非常独立单一，便于检索和构建知识仓库，使用户可以直接进行知识元的查询与分析，在改变知识结构的同时快速进行创新知识内容的提取。

2.2.3 合理设置知识元标引，有效完成知识仓库的知识管理

目前，文献知识标引、检索等主要停留在将整篇文献作为单元、选择不同的主题词或引文索引方面，强调利用文本知识发现文献内的细节信息及不同篇章之间的关联。生物医药科学数据共享平台建设，可以利用文献的知识元科学合理地完成标引设置，揭示文献内知识元与学科知识结构链接间的关系，寻找信息、知识导航链接的规律，使用户直接有效提取知识元，掌握更多知识元的使用方式，确保能够对各类数据信息进行全方位共享和开发利用。知识元标引能够有效进行知识元的过滤处理、各类连接的引用处理，将生物医学知识体系划分成不同类型的知识单元，能够在各知识单元中检索和寻找大量的知识元信息。例如，在疾病知识单元内检索相关疾病信息，在药品知识单元内进行药品信息的检索，在辅助检查知识单元内进行检查项目的检索，使数据共享平台的使用者可以利用此类功能快速检索到自己想要的数据信息、文献资料，科学化、合理化进行知识的检索与管理，提升知识元的开发利用效率、处理效果和检索存储效果[4]。

在数字化发展新理念的引领下，生物医药科学数据共享平台的构建与开发应遵循科学化、合理化的基本原则，完善其中的数据库、知识库等，明确平台的设计方式、设计思路和构建措施，利用先进的数字化技术，提升生物医学产业数据共享平台的建设水平。

猜你喜欢生物医药新理念检索湖北恒玖生物医药科技有限公司医疗装备(2022年20期)2022-11-11苏州浩欧博生物医药销售有限公司临床检验杂志(2022年8期)2022-10-19湖北恒玖生物医药科技有限公司医疗装备(2022年8期)2022-05-16苏州高新区：加速驶向医疗器械和生物医药产业“两千亿级”新蓝海华人时刊(2020年15期)2020-12-14新理念实干 高质量作为人大建设(2020年1期)2020-07-27现代调解的新理念与新思维人民调解(2019年1期)2019-03-15国外兴起长寿新理念华人时刊(2017年21期)2018-01-31新理念下再启航中国卫生(2016年2期)2016-11-12专利检索中“语义”的表现专利代理(2016年1期)2016-05-17国际标准检索质量与标准化(2010年5期)2010-05-03

推荐访问:数字化 新理念 生物医药